Dans chaque région, différents acteurs associatifs œuvrent à la protection des chauves-souris : (en gras : la structure rédactrice et/ou animatrice du plan régional) :
| Région | Associations en faveur des chauves-souris | Lien internet |
| Alsace | Groupe d’Etude et de Protection des Mammifères d’Alsace | http://gepma.free.fr/ gepma@free.fr |
| Aquitaine | Groupe Chiroptères Aquitaine | chiropteres.aquitaine@gmail.com |
| Auvergne | Chauve-Souris Auvergne | contact@chauve-souris-auvergne.fr |
| Conservatoire des espaces et paysages d’Auvergne | http://www.chauve-souris-auvergne.fr | |
| Conservatoire des sites de l’Allier | www.conservatoire-sites-allier.fr/ | |
| Alter Eco | ||
| Bourgogne | Société d’Histoire Naturelle d’Autun | http://www.shna-autun.net/ |
| Conservatoire des sites naturels de Bourgogne | http://www.csnb.fr/ | |
| Bretagne | Groupe Mammalogique Breton | http://www.gmb.asso.fr/ |
| Bretagne Vivante | http://www.bretagne-vivante.org/ http://www.nevez.org/ocb/ | |
| Amikiro | http://www.maisondelachauvesouris.com/ | |
| Centre | Sologne Nature | http://www.sologne-nature.org/ |
| Indre Nature | http://www.indrenature.net/%20target= | |
| Perche Nature | http://www.perchenature.fr/ | |
| Eure et Loir Nature | http://www.eure-et-loir-nature.asso.fr/ | |
| Les Corbeaux Gâtinais Nature | http://gatinais-nature.pagesperso-orange.fr/indexCORBEAUX.htm | |
| Nature 18 | http://www.nature18.org/ | |
| CPIE Val de Loire | http://www.cpie-val-de-loire.org/ | |
| LPO Touraine | http://www.lpotouraine.fr/ | |
| Conservatoire du patrimoine naturel de la régin Centre | http://www.cen-centre.org | |
| Loiret Nature Environnement | http://www.loiret-nature-environnement.org/ | |
| Champagne Ardenne | Conservatoire du patrimoine naturel de Champagne-Ardenne | http://www.chiropteres-champagne-ardenne.org/ |
| Ligue de l’Enseignement Aube | http://www.laligue10.org/ | |
| Ligue pour la Protection des Oiseaux Champagne-Ardenne | http://champagne-ardenne.lpo.fr/ | |
| CPIE Pays de Soulaine | http://www.crdp-reims.fr/cddp10/cpie/ | |
| Regroupement des Naturalistes Ardennais (ReNArd) | http://renard-asso.org/ | |
| Groupe chiroptères des Naturalistes de Champagne-Ardenne | http://lesnouvellesnca.blogspirit.com/groupe_chiropteres/ | |
| Corse | Groupe Chiroptères Corse | http://www.chauvesouriscorse.fr/ |
| Conservatoire des espaces naturels de Corse | cren-corse@espaces-naturels.fr | |
| Franche Comté | Commission de protection des eaux, du patrimoine, de l’environnement, du sous-sol et des chiroptères Franche Comté | http://www.cpepesc.org/ |
| Ile de France | Azimut 230 | mailto:laurent.tillon@aliceadsl.fr http://azimut230.over-blog.com/ |
| Languedoc Roussillon | Groupe Chiroptères Languedoc Roussillon | http://www.le-vespere.org/%20target= |
| Myotis ALEPE | http://lozere.alepe.over-blog.com/ | |
| Espace Nature Environnement Emarginatus Conservatoire des espaces naturels du Languedoc Roussillon | http://www.cenlr.org/ | |
| Limousin | Groupe Mammalogique et Herpétologique du Limousin | http://www.gmhl.asso.fr/ |
| Conservatoire des espaces naturels du Limousin | http://www.conservatoirelimousin.com/ | |
| Lorraine | Commission de protection des eaux, du patrimoine, de l’environnement, du sous-sol et des chiroptères Lorraine | http://www.cpepesc-lorraine.fr/ |
| Neomys Conservatoire des sites lorrains | http://www.cren-lorraine.fr/ | |
| Midi-Pyrénées | Conservatoire Régional des Espaces Naturels de Midi Pyrénées | http://www.cren-mp.org |
| Groupe chiroptères Midi Pyrénées | ||
| Nord Pas de Calais | Coordination mammalogique du Nord de la France | http://www.cmnf.fr/ |
| Conservatoire des Sites du Nord et du Pas de Calais | http://www.conservatoiresitesnpc.org/ | |
| Basse Normandie | Groupe Mammalogique Normand | http://www.gmn.asso.fr/ |
| Conservatoire Fédératif des Espaces Naturels de Basse Normandie | http://www.cfen-bassenormandie.org/ | |
| Haute Normandie | Groupe Mammalogique Normand | http://www.gmn.asso.fr/ |
| Conservatoire des Sites Naturels de Haute-Normandie | www.cren-haute-normandie.com | |
| Pays de la Loire | Groupe Chiroptère des Pays de la Loire LPO Anjou (49) | http://chauvesouris-pdl.org/ |
| Conservatoire du Patrimoine naturel Sarthois (72) | www.sarthe.com/cpns | |
| LPO Vendée (85) | http://vendee.lpo.fr/ | |
| Mayenne Nature Environnement (53) | http://www.mayennenatureenvironnement.fr/ | |
| Groupe Naturaliste Loire-Atlantique (44) | http://www.gnla.fr/joomla/ | |
| Les Naturalistes Vendéens (85) | ||
| Mauges Nature (49) CPIE Vallées de la Sarthe et du Loir (72) | http://www.cpie72.ouvaton.org/ | |
| CPIE Loire et Mauges (49) | http://www.cpie.paysdesmauges.fr/ | |
| SEPNB Bretagne Vivante (44) | http://www.bretagne-vivante.org/ | |
| Groupe Mammalogique Breton (44) | http://www.gmb.asso.fr/ | |
| Picardie | Picardie Nature | http://www.picardie-nature.org/%20target= |
| Conservatoire des Sites Naturels de Picardie | www.conservatoirepicardie.org | |
| Poitou Charentes | Deux Sèvres Nature Environnement | http://www.observatoire-environnement.org/dsne/ |
| Vienne Nature | http://www.vienne-nature.asso.fr/ | |
| Charente Nature | http://charente.nature.free.fr/ | |
| LPO | http://www.lpo.fr/ | |
| Nature Environnement 17 | http://www.nature-environnement17.org/ | |
| Conservatoire des espaces naturels de Poitou Charentes | www.cren-poitou-charentes.org | |
| Provence Alpes Côte d’Azur | Groupe Chiroptères Provence | http://www.gcprovence.org/ http://www.gcprovence.org/petitrhino/ |
| Crave | http://crave.free.fr/ | |
| LPO Paca | http://paca.lpo.fr/ | |
| Conservatoire-Etudes des Ecosystèmes de Provence | www.ceep.asso.fr | |
| Conservatoire-Etudes des Ecosystèmes de Provence | www.ceep.asso.fr | |
| Rhône Alpes | CORA Faune sauvage | www.corafaunesauvage.fr |
| Conservatoire Rhône Alpes des Espaces naturels | www.cren-rhonealpes.fr | |
| AVENIR | http://avenir.38.free.fr/ | |
|
Conservatoire du patrimoine naturel de la Savoie | www.patrimoine-naturel-savoie.org |